تعمل جمعية الحكمة على المساهمة في توفير المياه الصالحة للشرب للجميع، خصوصاً في المناطق الريفية. ومن أجل تحقيق تلك الغاية توفر برامج جمعية الحكمة في قطاع المياه برامج حفر الآبار السطحية، وحفر الآبار العميقة، وإنشاء وتأهيل مشاريع المياه ودعمها وتشغيلها. وتساهم من خلال هذه البرامج في توفير مصدر دائم للمياه الآمنة لسكان المناطق المستفيدة وزيادة نسبة الوصول إلى الماء الآمن، وتقليل معدلات الإصابة بالأمراض الناتجة عن عدم توفر المياه